Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mier3Q3UHF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mier3Q3UHF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms