Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr41Q3UDP0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr41Q3UDP0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms