Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U595 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U595 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U595 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U595 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U595 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U595 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U595 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms