Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms