Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms