Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms