Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms