Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms