Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lrrc28Q3TX51 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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