Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms