Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm1604bQ3TRG0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1604bQ3TRG0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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