Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms