Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms