Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp39Q3TIX9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms