Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RubcnlQ3TD16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms