Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms