Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec11Q3SXB8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms