Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3KNL4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3KNL4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms