Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M3Q31093 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms