Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmprss11cQ1JRP2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmprss11cQ1JRP2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmprss11cQ1JRP2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tmprss11cQ1JRP2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmprss11cQ1JRP2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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