Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rpusd3Q14AI6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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