Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem52bQ0VBF2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem52bQ0VBF2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tmem52bQ0VBF2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tmem52bQ0VBF2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tmem52bQ0VBF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem52bQ0VBF2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms