Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrriq1Q0P5X1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms