Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms