Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms