Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms