Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms