Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms