Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms