Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms