Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms