Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms