Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms