Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb1Q02819 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb1Q02819 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms