Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cacna1sQ02789 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms