Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms