Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms