Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms