Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brca2P97929 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brca2P97929 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms