Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SirpaP97797 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SirpaP97797 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SirpaP97797 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SirpaP97797 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SirpaP97797 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SirpaP97797 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms