Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms