Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms