Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps45P97390 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms