Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms