Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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