Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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