Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnab1P63143 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnab1P63143 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms