Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms