Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Depdc5P61460 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms