Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms